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GMMX构象搜索模块
发布时间:2017-08-30 23:44:38    【打印】  【关闭
 

为什么需要GMMX?

● 你是否因为体系过于复杂而无法确定其最稳定构象?
● 你是否因为有多个构象而无法确定每个构象所占比例大小?
● 你是否因为有多个构象而无法确定其在光谱中的贡献?
● 你是否因为......?

GMMX将能帮助你轻松解决以上问题

● GaussView 6 可以使用新增GMMX模块进行构象搜索。你可以通过以下一种或多种方法进行构象搜索:
● 对于 Cartesian 搜索,每个重原子将在X, Y, Z方向上随机移动一个距离。
● 对于Bonds方法,每个已选择的键将会随机旋转一个值,这会使分子构象产生较大变化。
● 对于环状化合物,在Bonds方法中提供了Ringmaker策略。它将打开环中的一根键,旋转其余键,然后再试图重新闭环。如果闭环之后的键长及键角不合理,那么此构象将不会采纳,程序将会进入下一个可能的搜索。
● 一旦GMMX 搜索完成,所有的构象信息将会列出,你可以使用GaussView 6以单个分子组形式打开和查看。同样,你可以查看这些构象的能量。对于大部分研究者来说这是一个非常重要的功能。

GaussView 6 可以使用新增GMMX模块对所研究分子进行构象搜索,并且显示各个构象的能量。
 
 
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