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软件教程
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原创精选
便捷搜索
快速入门和提高
教程列表27条
【2019-03-23】教程(五)过渡态搜索(二)
(一)引言:
➢ 过渡态搜索是计算化学中一个很重要的内容,它研究化学反应的动力学方面的信息。过渡态搜索将分为多个部分进行介绍,本文作为第二部分将给初学者介绍另外一种过渡态寻找方法(Opt=TS)。
➢ 在第一部分内容中我们讲到,Gaussian 16中提供3种找过渡态的方法,对应关键词分别为TS (需要猜测过渡态结构), QST2(需要输入反应物和产物结构), QST3(需要输入反应物
【2019-03-10】教程(四)GMMX构象搜索模块安装
(一)引言:
➢ GaussView 6 可以使用新增GMMX模块进行构象搜索。
➢ 一旦GMMX 搜索完成,所有的构象信息将会列出,你可以使用GaussView 6以单个分子组形式打开和查看。同样,你可以查看这些构象的能量。对于大部分研究者来说这是一个非常重要的功能。
➢ 本文主要讲解如何将GMMX内置于GaussView 6中
(二)安装过程:
【2019-03-07】教程(三)利用大小基组方法加速过渡态寻找
(一)引言:
➢ 在过渡态结构优化时,如果体系比较大,在大基组情况下则需要消耗较多的计算资源及时间,特别是某些过渡态用opt=(calcfc,ts, noeigentest)或opt=(calcfc,qst2, noeigentest)方法很难找到的情况下,如何寻找过渡态以及如何有效加速过渡态寻找是研究者经常遇到的问题。本文以1,2-丙二醇体系脱水形成环氧丙烷反应为例,提供一种有效、可行
【2019-02-13】教程(二)过渡态搜索(一)
(一)引言:
➢ 过渡态搜索是计算化学中一个很重要的内容,它研究化学反应的动力学方面的信息。过渡态搜索将分为多个部分进行介绍,本文作为第一部分将为初学者介绍一种切实可行的过渡态搜索方法。
➢ Gaussian 16中提供3种找过渡态的方法,对应关键词分别为TS (需要猜测过渡态结构), QST2(需要输入反应物和产物结构), QST3(需要输入反应物,产物结构和过渡态结构)。 对于
【2018-12-28】教程(一)弱相互作用能计算中基组重叠误差(BSSE)的校正
(一)引言:
在计算弱相互作用体系时,论文中一般要求加入BSSE校正,本文将以H2O和NH3分子为例介绍如何计算BSSE校正能量。
(二)计算过程:
1. 复合物结构优化和频率分析
█软件:Gaussian 16, GaussView 6
█本文使用方法为M06-2X/6-311+G(d,p) 基组,并加入色散校正项。
█优化结束后,进行频率分
【2014-04-03】关于TDDFT的一些背景知识和使用技巧(第二讲)
线性响应TDDFT通过一系列数学变换,最终可以得到一个线性本征方程(Linear Eigenequation)。
这个方程里面,A和B是从哈密顿算符(Hamiltonian)在基函数里面的表征,跟体系基态的分子轨道紧密相连。X和Y可以看做是电子往上和往下跃迁的振幅,ω就是跃迁的频率,也就是激发态和基态的能量差 。这个方程跟CIS相比,多了B这项,同时也多了Y这一本征向量。
【2014-03-19】关于TDDFT的一些背景知识和使用技巧(第一讲)
TDDFT是密度泛函的含时薛定谔方程。含时薛定谔通常以时间(Time)或者频率(Frequency)来表征其方程解。两种解的对应关系可以从傅立叶(Fourier)变换得到。以频率做TDDFT的方程解的时候,得到的频率就是分子的激发能。在频率自由度上解析TDDFT的时候,又有很多种方法。绝大部分的方法是对TDDFT进行一阶近似,也就是常说的线性响应TDDFT(Linear Response TDDF